J'ai rencontré ce problème avec les Conky de largeur variable (quand on affiche les ports ouverts et l'adresse distante par exemple).

Pour y remédier il faut fixer la largeur du Conky, en spécifiant une largeur minimale et une largeur maximale identiques :

minimum_size 260
maximum_width 260

Par défaut la taille du buffer de conky est de 128. Si votre conky comporte une grande quantité de textes et d'images, il est possible que tout ne s'affiche pas correctement.

Pour y remédier il faut rajouter au .conkyrc avant la section TEXT :

text_buffer_size 1024